性状鉴别丹参根茎短粗，顶端有时残留茎基。根数条，长圆柱形，稍弯曲，有的分枝，并具须状细根，长10～20cm，直径3～10mm;表面棕红色或暗棕红色，粗糙，具不规则的纵皱纹，外皮有时呈鳞片状剥落。质硬而脆，断面疏松，有裂隙或略平整而致密，皮部棕红色，木部灰黄色或紫褐色，可见黄白色点状维管束。气微，味微苦涩。甘西鼠尾草根圆锥形，长10～20cm，直径1～4cm;表面暗棕红色，根头部常由1至数个根茎合着，根部扭曲或呈辫子状，外皮常有部分脱落而显红褐色。云南鼠尾草根茎短，根纺锤形，红色，长3～5cm。显微鉴别丹参根(直径约1cm)横切面：木栓层为4～6列细胞，有时可见落皮层。皮层Chemicalbook宽广。韧皮部呈半月形。束间形成层不甚明显。木质部8至10数束呈放射状，导管在近形成层处较多呈切向排列，渐至中央呈单列，木纤维常成束存在于初生木质部旁。粉末：红棕色，气微，味淡。①石细胞呈类圆形、类三角形、类梭形、类长方形或不规则形，也有延长呈纤维状，边缘不平整，直径20～65μm，长约至257μm，壁厚5～16μm，有的胞腔内含棕色物。②网纹导管及具缘纹孔导管直径11～50μm;网纹导管分子长梭形，边缘不平整，壁增厚不均匀，网孔狭细，穿孔多位于侧壁，具缘纹孔类圆形，排列紧密，有的具网状三生增厚。③木纤维多成束，呈长梭形，末端长尖或稍倾斜，长18～25μm，壁厚2～4μm。