纽甜进入人体后，约有一半以3，3-二甲基丁基天冬氨酰苯丙氨酸(DMB-Asp-Phe)的形式由粪便排出体外。另一半被原封不动地吸收，然后再进一步水解成DMB-Asp-Phe和甲醇。这其中的大部分DMB-Asp-Phe(半衰期为2h)是通过尿排出，而不会在任何组织中有较多的残留;另外只有一小部分被机体代谢，通过氧化3，3-二甲基丁基部分形成3，3-二甲基丁酸，作为人体的一种肉碱酯(Carnitineester，少于纽甜摄入量的5%)由尿液排出。值得注意的是，阿斯巴甜的代谢分解与纽甜有很大不同。阿斯巴甜在的内腔或黏膜细胞中就分Chemicalbook解成3种成分——天冬氨酸(Asp)、苯丙氨酸(Phe)和甲醇。这些成分被吸收，进入人体循环，进入氨基酸代谢循环中。因此可认为，阿斯巴甜被完全代谢吸收，而超过90%的纽甜都是通过排泄物排出体外的。在阿斯巴甜的代谢过程中可释放出55%的苯丙氨酸。苯丙氨酸是人体的8种氨基酸中的1种，进入通常的代谢途径进行代谢，但是患有(PKU)的缺乏代谢苯丙氨酸的能力。尽管与肉、奶及其他蛋白质食品相比，阿斯巴甜中的苯丙氨酸含量很低。但很多国家都规定，含有阿斯巴甜的食品必须在包装上注明该产品含有苯丙氨酸，以提醒PKU的注意。