奶酪的包装和贮存条件对其货架寿命的影响极大。一般的奶酪，对包装都有共同的要求。，必须隔氧，以防止长霉和变质；第二，保持水分，以维持其柔韧组织，且免于失重。一般来说，奶酪的含水量越高，越是容易变质和腐败。霉菌如青霉菌是造成奶酪变质的重要因素，并且经常出现在奶酪表面的裂纹和小孔内。奶酪皮一般不干燥，所以容易长霉。尽管在低温贮存条件下，奶酪中的酸值也不足以抵制霉菌的生长。尽管在低温贮存条件下，奶酪中的酸值也不足以抵制细菌的生长。含水量高的软干酪和奶油干酪非常容易受到酵母和霉菌的侵袭而发生变质。奶酪通常采用内表面涂有热封涂料的铝箔包装。由于引起奶酪变质的微生物都是嗜氧菌，因此，奶酪应当采取隔氧包装。倘若采用真空和充以惰性保护气体的密封包装，则其保护效果更好。这些包装方法业已在商业上应用。