低聚甘露糖的生产方法有五种：

(1)从天然原料中抽提；

(2)利用转移酶、水解酶之转移反应生成；

(3)利用酸水解天然多糖生成；

(4)利用酶水解天然多糖生成；

(5)化学合成法生产。

但实用价值的是利用生物技术的酶法水解多糖方法米生产。酶法制取低聚甘露糖系采用微生物产生的B一甘露聚糖酶，水解含有甘露聚糖大分子的可食性植物胶制取低聚糖产晶。该技术的关键之一在于获得一个优良的B一甘露聚糖酶生产菌，要求该菌株不但产酶活性高、产酶稳定，而且所产酶组分单一，糖菅酶活性低，最适温度与pH适宜于工业化应用。

酶解植物胶的水解液是由单糖和低聚糖等组成的混合物。要提高产品质量，必须设法降低其中的单糖含量。为了消除低聚果糖生产中葡萄糖的，提高产品质量。

低聚甘露糖的提取工艺也是项目实施产业化的制约因素之一。水解液需经过分离、浓缩、干燥后才能制成粉末状产晶。下游加工工序繁杂，投资巨大，而且决定着产品的质量。这有赖于高效、稳定、易于工业化生产的生化分离手段的建立与完善。