在中枢，尤其是在脊椎里，甘氨酸是一个抑制性神经递质。假如甘氨酸接受器被激活，氯离子通过离子接受器进入导致抑制性突触后电位。是这些离子接受器的拮抗物。在鼠体内其LD50指标为0.96毫克/千克体重，死因是超兴奋性。在中枢中甘氨酸与谷氨酸同是激动剂。甘氨酸以往一直被认为是除了GABA以外最重要的抑制性神经递质。甘氨酸在CNS中有广泛的分布,在神经信号的传递以及参与各种生理和病理反应中起着的重要基础作用。

食品

用作生化试剂，用于医药、饲料和食品添加剂，氮肥工业用作无毒脱碳剂；

营养增补剂。主要用于调味等方面；

对枯草杆菌及大肠杆菌的繁殖有一定。故可用作鱼糜制品、花生酱等的防腐剂，添加量1%～2%；

抗氧化作用（利用其金属螯合作用）添加于奶油、干酪、人造奶油可延长保存期3～4倍；

为使焙烤食品中的猪油稳定，可添加葡萄糖2.5%和甘氨酸0.5%；

速煮面用的小麦粉中添加0.1%～0.5%，同时可起调味作用