有学者探究了柠檬酸钠对小鼠生理及菌群的影响，结果表明，膳食中柠檬酸钠的添加能降低试验小鼠的体重，而高剂量的柠檬酸钠可提高小鼠血清中胆固醇的含量。通过对小鼠粪便样品的菌群分析，发现柠檬酸钠的添加会影响其beta多样性。在门水平上，与空白组相比，摄食柠檬酸钠不会影响微生物所属门的种类，但会使厚壁菌门和拟杆菌门的比例发生变化，但是由于小鼠自身的个体差异很大，并且大部分的柠檬酸钠可能在小肠部位被吸收，因此，结果未呈现一定规律性。

生物降解性

柠檬酸钠经自然界大量的水稀释后，部分变成柠檬酸，两者共存于同一体系中。柠檬酸在水中经氧、热、光、细菌以及微生物的作用，很容易发生生物降解。其分解途径一般是经乌头酸、衣康酸、柠康酸酐，转变为二氧化碳和水。

络合能力

柠檬酸钠对Ca2+、Mg2+等金属离子具有良好的络合能力，对其他金属离子，如Fe2+等离子也有很好的络合能力。