D-木糖作为一种新兴的功能性食品配料，因具有优良的加工特性和多种生理调节功能，被广泛应用于各种功能性食品中，其生理调节功能主要有以下几方面：

调节菌群，促进双岐杆菌增殖

D-木糖能够选择性的促进双歧杆菌等有益菌的增殖，使其成为优势菌群，调节微生态平衡，促进健康。双歧杆菌是人体内的正常栖居的菌群，它能够选择性的代谢D-木糖产生大量短链脂肪酸，相反，中的葡萄球菌、大肠杆菌和许多梭状芽孢杆菌都不能利用D-木糖。双歧杆菌代谢D-木糖产生的短链脂肪酸主要是乳酸和醋酸，能够降低的pH值，抑制了其它有害菌的繁殖，使人体内的吲哚、酚、氨和尸胺等有害代谢物质明显减少，从而降低了人体患等的机率。同时，酸性环境的改善还能刺激，增加粪便湿润度，促进排便，从而发生，减少宿便对便秘带来的危害，同时，D-木糖通过调节菌群对也有一定的作用，因而它是一种具有通便和的双向调节剂。