低聚异麦芽糖能促进内双歧杆菌增殖，抑制有害菌及腐败物质形成，增加维生素含量，。低聚异麦芽糖不会被胃和小肠吸收，而是直接进入大肠，被双歧杆菌优先利用，助其大量繁殖，系为双歧杆菌增殖因子；而肠内其它有害菌则不能利用，从而能抑制有害菌生长，促使内微生态向良性循环调整。如：

①维持正常细菌群平衡，尤其是老年和婴儿。双歧杆菌能抑制病原菌和腐败菌生长，、下痢和胃肠障碍。

②双歧杆菌。

③双歧杆菌能在内合成维生素B1、B2、B6、K、尼克酸、叶酸等及某些氨基酸，提高对钙离子吸收。

④降低血中，。

⑤改善乳制品消化率，提高耐乳糖性。国外许多乳制品都添加低聚麦芽糖，以提高其保健功能。

⑥，预防抗生素类对人体各种不良副作用。

(3)预功能。低聚异麦芽糖不被链球菌利用，不被口腔酶液分解，因而能防止。具有异麦芽糖残基低聚异麦芽糖与蔗糖结合使用时会强烈抑制不溶性葡聚糖合成，从而阻止齿垢形成，使蛀芽菌不能在牙齿上附着生长繁殖。因此，低聚异麦芽糖在以蔗糖为原料食品中，具有作用。