八十年代末期，溶氧和染菌是困扰我国黄原胶工业化生产的两大难题。随着 GSM发酵罐的发明和染菌问题的解决，黄原胶也就进入了产业化阶段。但随着生产规模的扩大和市场的拓展，黄原胶的质量问题就日益凸现出来。当然影响黄原胶成品质量问题是多方面的，诸如原料的选择、原料的合理配比、菌种选育、发酵工艺、后处理工艺、生产设备等都会影响其质量。但目前影响国内黄原胶质量的因素是菌种问题、发酵工艺和后处理工艺三个方面。

通过对国内外产品的化验分析和有关部门的查新证明，国产黄原胶与美国的KELCO公司和法国的Phone-Poulen公司产品有六大差别：黄原胶色泽较深；成品颗粒不够均匀；不同批次间比重不一；溶解性较差；成品粘度较低且耐热、酸碱的稳定性较差；成品的灰分、含氮量略高；微生物指标偏高。