亚麻籽胶主要从脱脂饼粕或亚麻籽种子中提取，通常采用水提取法，提取工艺流程是以亚麻籽榨油后的脱脂亚麻籽粕为原料，再用水、稀盐溶液或稀乙醇提取得到胶液。

在亚麻籽胶提取的过程中，浸提剂、浸提温度、时间、搅拌速度都对亚麻籽胶的质量有一定影响。通过对酸、碱和水分别作为浸提剂的提取效果的对比发现，用酸和碱提取都比用水提取得到的亚麻籽胶的粘度低，而且用水做浸提剂也能避免化学药品对产品的污染；温度、时间和搅拌速度三个因素中，以温度对亚麻籽胶的粘度影响，而时间对产率影响。

亚麻籽胶的产率和蛋白质的含量随提取的温度和原料的性质而变化，在4℃提取得到的亚麻籽胶的纯度高，但产率低；随提取温度的升高，亚麻籽胶的产率增加，同时亚麻籽胶中蛋白质的含量也增加，亚麻粕中提取的胶中蛋白质含量高于从种子中直接提取的胶中蛋白质含量。