施肥：定植后到成活前，必须及时浇水，保持土壤湿润。成活后，一般不需浇水，但要及时中耕除草，合理施肥。早春芽萌发前，施1次人粪尿，数量视植株大小而定。2-3年的小树，每株用肥5千克左右；10年以上的大树，每株10-15千克。开花前再施肥1次，每株婀土杂肥10-40千克，以促进多孕臂。开花后增施一次磷钾肥，每株施过磷酸钙1-2千克，再撒草木灰1.5-2.5千克，有利于果实增大饱满，并可减少落果，提高产量。秋末冬初，再施过冬肥，每株施厩肥、焦泥灰或垃圾18-20千克，并培土予植株基部，以利保暖防冻。

整枝：冬季落叶后到翌春发芽前，进行适当修剪。幼树在离地1-1.3米高处，剪去顶心，促使分枝。老树适当剪去过密或重叠枝条，保留健壮、芽胞肥大的枝条。同时剪去有病虫害的枝条，并将病枝集中烧毁。

间作：成片种植吴茱萸，前几年植株矮小，株间空地多。为了提高土地利用率，增加收益，可在林地套种落花生、大豆、番薯等作物。